MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori Sat464 plasmid pHPSAT464

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017356	AAC	2	6	63	68	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
2	NC_017356	A	6	6	84	89	100 %	0 %	0 %	0 %	384893582
3	NC_017356	AGA	2	6	175	180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893582
4	NC_017356	A	6	6	203	208	100 %	0 %	0 %	0 %	384893582
5	NC_017356	AACC	2	8	217	224	50 %	0 %	0 %	50 %	384893582
6	NC_017356	ACAA	2	8	251	258	75 %	0 %	0 %	25 %	384893582
7	NC_017356	AAC	2	6	284	289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
8	NC_017356	CAA	2	6	292	297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
9	NC_017356	GTG	2	6	452	457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893582
10	NC_017356	ATTGA	2	10	560	569	40 %	40 %	20 %	0 %	384893582
11	NC_017356	CTAC	2	8	625	632	25 %	25 %	0 %	50 %	384893582
12	NC_017356	CTT	2	6	660	665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893582
13	NC_017356	AAC	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
14	NC_017356	AAG	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893582
15	NC_017356	CTT	2	6	1088	1093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893582
16	NC_017356	CAA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893582
17	NC_017356	TGTT	2	8	1269	1276	0 %	75 %	25 %	0 %	384893582
18	NC_017356	A	6	6	1292	1297	100 %	0 %	0 %	0 %	384893582
19	NC_017356	AGA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893582
20	NC_017356	AAGGA	2	10	1600	1609	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017356	CATG	2	8	1610	1617	25 %	25 %	25 %	25 %	384893583
22	NC_017356	A	7	7	1661	1667	100 %	0 %	0 %	0 %	384893583
23	NC_017356	CAAAT	2	10	1702	1711	60 %	20 %	0 %	20 %	384893583
24	NC_017356	A	7	7	1799	1805	100 %	0 %	0 %	0 %	384893583
25	NC_017356	TGA	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893583
26	NC_017356	ATCA	2	8	1840	1847	50 %	25 %	0 %	25 %	384893583
27	NC_017356	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893583
28	NC_017356	GAA	2	6	1882	1887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893583
29	NC_017356	AAT	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893583
30	NC_017356	ATT	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893583
31	NC_017356	A	6	6	1966	1971	100 %	0 %	0 %	0 %	384893583
32	NC_017356	GGT	2	6	1987	1992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384893583
33	NC_017356	CAC	2	6	1995	2000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384893583
34	NC_017356	CAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893583
35	NC_017356	TTTCT	2	10	2319	2328	0 %	80 %	0 %	20 %	384893583
36	NC_017356	TCT	3	9	2326	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384893583
37	NC_017356	TCAA	2	8	2380	2387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017356	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017356	ATGAA	2	10	2472	2481	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017356	GGT	2	6	2539	2544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017356	ATCT	2	8	2608	2615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017356	T	6	6	2740	2745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017356	AAGT	2	8	2875	2882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017356	TGAA	2	8	2886	2893	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017356	A	7	7	2916	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017356	CTTT	2	8	2942	2949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017356	A	6	6	2961	2966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017356	T	6	6	2984	2989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017356	TGCTA	2	10	3096	3105	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017356	CTT	2	6	3153	3158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017356	GAAGT	2	10	3166	3175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017356	TGT	2	6	3214	3219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017356	T	6	6	3295	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	384893584
54	NC_017356	GAT	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893584
55	NC_017356	AGCGAT	2	12	3338	3349	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384893584
56	NC_017356	TCAA	2	8	3378	3385	50 %	25 %	0 %	25 %	384893584
57	NC_017356	TTTGA	2	10	3590	3599	20 %	60 %	20 %	0 %	384893584
58	NC_017356	T	6	6	3630	3635	0 %	100 %	0 %	0 %	384893584
59	NC_017356	GAG	2	6	3656	3661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384893584
60	NC_017356	AC	3	6	3743	3748	50 %	0 %	0 %	50 %	384893584
61	NC_017356	TCA	2	6	3774	3779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
62	NC_017356	GAA	2	6	3801	3806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
63	NC_017356	TTA	2	6	3890	3895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384893584
64	NC_017356	GAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
65	NC_017356	AGA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
66	NC_017356	AAC	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893584
67	NC_017356	GAT	2	6	4175	4180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384893584
68	NC_017356	AAAG	2	8	4184	4191	75 %	0 %	25 %	0 %	384893584
69	NC_017356	AAAG	2	8	4215	4222	75 %	0 %	25 %	0 %	384893584
70	NC_017356	A	6	6	4240	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	384893584
71	NC_017356	A	6	6	4301	4306	100 %	0 %	0 %	0 %	384893584
72	NC_017356	AG	3	6	4367	4372	50 %	0 %	50 %	0 %	384893584
73	NC_017356	A	6	6	4397	4402	100 %	0 %	0 %	0 %	384893584
74	NC_017356	CTA	2	6	4409	4414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
75	NC_017356	CTA	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
76	NC_017356	ACA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893584
77	NC_017356	CA	3	6	4507	4512	50 %	0 %	0 %	50 %	384893584
78	NC_017356	AAT	2	6	4517	4522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384893584
79	NC_017356	T	7	7	4536	4542	0 %	100 %	0 %	0 %	384893584
80	NC_017356	CCTA	2	8	4664	4671	25 %	25 %	0 %	50 %	384893584
81	NC_017356	AAAG	2	8	4748	4755	75 %	0 %	25 %	0 %	384893584
82	NC_017356	ACT	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384893584
83	NC_017356	AGA	3	9	4789	4797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384893584
84	NC_017356	AG	3	6	4813	4818	50 %	0 %	50 %	0 %	384893584
85	NC_017356	CAAA	2	8	4888	4895	75 %	0 %	0 %	25 %	384893584
86	NC_017356	AAC	2	6	5066	5071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384893584
87	NC_017356	CAAA	2	8	5095	5102	75 %	0 %	0 %	25 %	384893584
88	NC_017356	AAAGCC	2	12	5111	5122	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384893584
89	NC_017356	AGAAAA	2	12	5140	5151	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384893584
90	NC_017356	GAAA	2	8	5233	5240	75 %	0 %	25 %	0 %	384893584
91	NC_017356	AACA	2	8	5377	5384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017356	ACAAA	2	10	5434	5443	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017356	T	6	6	5449	5454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017356	GCG	2	6	5460	5465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017356	TTA	2	6	5491	5496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017356	ACTCAA	2	12	5546	5557	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017356	AAAC	2	8	5580	5587	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017356	CCTAAT	2	12	5668	5679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017356	C	6	6	5684	5689	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_017356	ACA	2	6	5690	5695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017356	TTTTC	2	10	5723	5732	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017356	ACCCT	2	10	5773	5782	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_017356	T	6	6	5845	5850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017356	T	6	6	5852	5857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017356	CTTTTT	2	12	5860	5871	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017356	T	8	8	5867	5874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017356	T	6	6	5902	5907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017356	A	8	8	5909	5916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017356	CATGA	2	10	5927	5936	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017356	GAAA	2	8	5970	5977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017356	CTTT	2	8	5985	5992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017356	AATTT	2	10	6119	6128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017356	ATT	2	6	6166	6171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017356	G	6	6	6181	6186	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017356	T	6	6	6224	6229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017356	TAG	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017356	T	6	6	6402	6407	0 %	100 %	0 %	0 %	384893585
118	NC_017356	TA	3	6	6418	6423	50 %	50 %	0 %	0 %	384893585
119	NC_017356	T	7	7	6432	6438	0 %	100 %	0 %	0 %	384893585
120	NC_017356	A	6	6	6483	6488	100 %	0 %	0 %	0 %	384893585
121	NC_017356	A	8	8	6496	6503	100 %	0 %	0 %	0 %	384893585
122	NC_017356	TAG	2	6	6562	6567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017356	T	6	6	6607	6612	0 %	100 %	0 %	0 %	384893586
124	NC_017356	TA	3	6	6623	6628	50 %	50 %	0 %	0 %	384893586
125	NC_017356	T	7	7	6637	6643	0 %	100 %	0 %	0 %	384893586
126	NC_017356	A	6	6	6688	6693	100 %	0 %	0 %	0 %	384893586
127	NC_017356	A	8	8	6701	6708	100 %	0 %	0 %	0 %	384893586
128	NC_017356	TAG	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017356	T	6	6	6812	6817	0 %	100 %	0 %	0 %	384893587
130	NC_017356	TA	3	6	6828	6833	50 %	50 %	0 %	0 %	384893587
131	NC_017356	T	7	7	6842	6848	0 %	100 %	0 %	0 %	384893587
132	NC_017356	A	6	6	6893	6898	100 %	0 %	0 %	0 %	384893587
133	NC_017356	A	8	8	6906	6913	100 %	0 %	0 %	0 %	384893587
134	NC_017356	CAT	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017356	GTT	2	6	6955	6960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017356	T	6	6	6990	6995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017356	ACC	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017356	CTT	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017356	CTT	2	6	7124	7129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017356	CTT	2	6	7146	7151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017356	CTT	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017356	A	7	7	7195	7201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.